目前，自闭症的病因尚不清楚，越来越多的证据表明，许多因素参与了该疾病的发生、发展和预后。
1.遗传因素:对自闭症双胞胎共病率的研究表明，自闭症谱系障碍的遗传率在37%-90%之间。15%的自闭症谱系障碍患者可能与已知的基因突变有关。
2.环境因素:一些非特异性的危险因素，如高生育年龄、低出生体重或胎儿期暴露于丙戊酸钠，可能是自闭症谱系障碍的危险因素。
3.神经生化因素:研究表明，自闭症患者脑内血清素、多巴胺等神经递质代谢异常，可以在一定程度上解释刻板重复行为和情绪障碍。
4.脑器质性因素:研究表明，自闭症患者有围产期脑损伤、脑电图异常、神经系统体征和癫痫发作。这表明部分自闭症患者的大脑结构和功能存在异常。
5.心理因素:到目前为止，我们还无法衡量一个自闭症儿童发病中先天遗传因素的程度，但有时早期发展中不良的养育方式是非常明显的。
我们接触到一些自闭症的案例，比如孩子的父亲在外工作，忙碌的母亲没有时间照顾年幼的孩子。为了不让孩子哭，让电视陪着孩子。在言语人际交往最关键的时期，没有人会陪伴孩子。结果可想而知。另一个孩子父母工作忙，孩子3岁以内多次给别人。孩子不断遇到陌生的照顾者，内心逐渐封闭。我们总能从孩子的成长经历和亲子关系中找到一些导致孩子心理问题的线索。
自闭症来源于大脑的遗传易感性，大脑发育过程中各种理化因素造成的损伤，以及早期生活中不良养育方式的共同原因。
